রাদারফোর্ড প্রকল্পের ভৌম অবস্থায় ইলেকট্রনগুলি স্থিতিসাম্যে থাকে। কিন্তু থমসন প্রকল্পে ইলেকট্রন সর্বদা একটি লব্ধি বল অনুভব করে ।

রাদারফোর্ড প্রকল্পে পরমাণুতে ভর সুষমভাবে বন্টিত থাকে কিন্তু থমসন প্রকল্পে পরমাণুতে ভর অবিন্যস্তভাবে বন্টিত থাকে ।

সনাতন তত্ত্বানুসারে রাদারফোর্ড প্রকল্পে পরমাণুর সংকোচন ও ধ্বংস অনিবার্য।

রাদারফোর্ড প্রকল্পে পরমাণুর ধনাত্বক অংশে বেশিরভাগ ভর থাকে কিন্তু থমসন প্রকল্পে সেটি ঘটে না।